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具有抗-NECTIN4嵌合抗原受體的基因工程化細(xì)胞及其用途的制作方法

文檔序號:42663491發(fā)布日期:2025-08-05 18:51閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(ipsc)或其衍生細(xì)胞,其包含:

2.權(quán)利要求1的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中:

3.權(quán)利要求1或2的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述car包含抗-nectin4?vhh結(jié)構(gòu)域。

4.權(quán)利要求1-3中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述細(xì)胞因子包含il-15。

5.權(quán)利要求4的ipsc或衍生細(xì)胞,其還包含失活的細(xì)胞表面受體,所述失活的細(xì)胞表面受體包含單克隆抗體特異性表位,并且其中所述失活的細(xì)胞表面受體和所述il-15通過自體蛋白酶肽可操作地連接。

6.權(quán)利要求4的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述il-15包含il-15和il-15受體α(il-15rα)融合多肽。

7.權(quán)利要求4-6中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述il-15包含與seq?id?no:72具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

8.權(quán)利要求1-7中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其包含b2m、tap?1、tap?2、tapasin、rfxank、ciita、rfx5和rfxap基因中的一個或多個的缺失或減少表達(dá)。

9.權(quán)利要求1-8中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其包含編碼人白細(xì)胞抗原e(hla-e)和/或人白細(xì)胞抗原g(hla-g)的外源多核苷酸。

10.權(quán)利要求1-9中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述cd16為cd16變體蛋白。

11.權(quán)利要求10的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述cd16變體蛋白為高親和力cd16變體。

12.權(quán)利要求10或11的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述cd16變體蛋白為不可切割的cd16變體。

13.權(quán)利要求10-12中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述cd16變體蛋白包含具有選自f158v、f176v、s197p、d205a、s219a、t220a的一個或多個氨基酸取代的野生型cd16。

14.權(quán)利要求10-13中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述cd16變體蛋白包含與seqid?no:187和188中的任一個具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

15.權(quán)利要求1-14中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其包含編碼所述cd16蛋白和所述nkg2d蛋白的外源多核苷酸,其中所述cd16蛋白和所述nkg2d蛋白通過自體蛋白酶肽可操作地連接。

16.權(quán)利要求15的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述nkg2d蛋白為野生型nkg2d蛋白。

17.權(quán)利要求15的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述nkg2d蛋白包含與seq?id?no:190具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

18.權(quán)利要求15-17中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述自體蛋白酶肽選自1型豬捷申病毒2a(p2a)肽、口蹄疫病毒2a(f2a)肽、甲型馬鼻炎病毒(erav)2a(e2a)肽、明脈扁刺蛾病毒2a(t2a)肽、質(zhì)型多角體病毒2a(bmcpv2a)肽和軟化病病毒2a(bmifv2a)肽。

19.權(quán)利要求18的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述自體蛋白酶肽為p2a肽,其包含與seqid?no:192具有至少90%序列相同性的氨基酸。

20.權(quán)利要求15-19中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述編碼cd16蛋白和nkg2d蛋白的外源多核苷酸包含與seq?id?no:193具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸。

21.權(quán)利要求1-20中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述外源多核苷酸中的一種或多種整合在細(xì)胞染色體上的一個或多個基因座上,所述基因座選自aavs1、clybl、ccr5、rosa26、膠原蛋白、htrp、hl?l、gapdh、runx1、b2m、tapi、tap2、tapasin、nlrc5、rfxank、ciita、rfx5、rfxap、tcra或b恒定區(qū)、nkg2a、nkg2d、cd33、cd38、cd70、trac、cis、cbl-b、socs2、pd1、ctla4、lag3、tim3和tigit基因,條件是所述外源多核苷酸中的至少一種整合在選自以下基因的基因座上:b2m、tap?1、tap?2、tapasin、rfxank、ciita、rfx5和rfxap基因,從而導(dǎo)致所述基因的缺失或減少表達(dá)。

22.權(quán)利要求1-21中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述外源多核苷酸中的一種或多種整合在aavs1和b2m基因的基因座上。

23.權(quán)利要求1-22中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其具有b2m或ciita基因中的一個或多個的缺失或減少表達(dá)。

24.權(quán)利要求23的ipsc或其衍生細(xì)胞,其包含b2m和ciita基因的缺失或減少表達(dá)。

25.權(quán)利要求1-24中任一項(xiàng)的ipsc,其中所述ipsc是由全外周血單個核細(xì)胞(pbmc)重編程的。

26.權(quán)利要求1-25中任一項(xiàng)的ipsc,其中所述ipsc衍生自重編程的t細(xì)胞。

27.權(quán)利要求1-26中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述car包含:

28.權(quán)利要求27的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述胞外域包含特異性結(jié)合至所述nectin4抗原的vhh單域抗體。

29.權(quán)利要求27或28的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述胞外域包含與seq?id?no:105-130之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

30.權(quán)利要求27或28的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中(i)所述胞外域由與seq?id?no:131-156之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼;或者(ii)所述car由與seq?id?no:171-184之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼。

31.權(quán)利要求2-30中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述額外的car包含:

32.權(quán)利要求31的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述額外的胞外域包含特異性結(jié)合至選自cd70、葉酸受體α、fshr、間皮素和slitrk6的抗原的vhh或scfv。

33.權(quán)利要求27-32中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述信號肽包含gmcsfr信號肽或mars信號肽。

34.權(quán)利要求27-33中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述car和所述額外的car中的每一個的鉸鏈區(qū)獨(dú)立地選自cd28鉸鏈區(qū)、igg4鉸鏈區(qū)和cd8鉸鏈區(qū)。

35.權(quán)利要求27-34中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述car和所述額外的car中的每一個的跨膜結(jié)構(gòu)域獨(dú)立地選自cd28跨膜結(jié)構(gòu)域和cd8跨膜結(jié)構(gòu)域。

36.權(quán)利要求27-35中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述胞內(nèi)信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域包含cd3ζ胞內(nèi)域。

37.權(quán)利要求27-36中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述car和所述額外的car中的每一個的共刺激結(jié)構(gòu)域獨(dú)立地選自cd28信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域、41bb信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域和dap10信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域。

38.權(quán)利要求27-37中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中在所述car中:

39.權(quán)利要求38的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中在所述car中:

40.權(quán)利要求1-39中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其包含編碼安全開關(guān)的外源多核苷酸。

41.權(quán)利要求40的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述安全開關(guān)包含外源多核苷酸,所述外源多核苷酸編碼失活的細(xì)胞表面受體,所述失活的細(xì)胞表面受體包含單克隆抗體特異性表位。

42.權(quán)利要求41的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述失活的細(xì)胞表面受體選自單克隆抗體特異性表位,其選自替伊莫單抗、莫羅單抗-cd3、托西莫單抗、阿昔單抗、巴利昔單抗、維布妥昔單抗、西妥昔單抗、英夫利昔單抗、利妥昔單抗、阿侖單抗、貝伐珠單抗、賽妥珠單抗、達(dá)利珠單抗、依庫珠單抗、依法利珠單抗、吉妥珠單抗、那他珠單抗、奧馬珠單抗、帕利珠單抗、維泊妥珠單抗、雷珠單抗、托珠單抗、曲妥珠單抗、維得利珠單抗、阿達(dá)木單抗、貝利尤單抗、卡那單抗、地舒單抗、戈利木單抗、伊匹單抗、阿維魯單抗、奧法木單抗、帕尼單抗和烏司奴單抗特異性識別的表位。

43.權(quán)利要求42的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述失活的細(xì)胞表面受體是截短的表皮生長因子(tegfr)變體。

44.權(quán)利要求43的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述tegfr變體由與seq?id?no:71具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸組成。

45.權(quán)利要求40-44中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述安全開關(guān)包含胞內(nèi)域,其具有單純皰疹病毒胸苷激酶(hsv-tk)。

46.權(quán)利要求1-45中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其包含編碼psma細(xì)胞示蹤劑的外源多核苷酸,其中所述psma細(xì)胞示蹤劑包含胞外域,所述胞外域包含psma胞外域或其片段。

47.權(quán)利要求46的ipsc或其衍生細(xì)胞,其包含組合的人工細(xì)胞死亡/報告系統(tǒng)多肽,所述組合的人工細(xì)胞死亡/報告系統(tǒng)多肽包含胞內(nèi)域、跨膜區(qū)和胞外域,所述胞內(nèi)域具有單純皰疹病毒胸苷激酶(hsv-tk)和接頭,所述胞外域包含psma胞外域或其片段。

48.權(quán)利要求45-47中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述hsv-tk包含與seq?id?no:229或230具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

49.權(quán)利要求47的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述組合的人工細(xì)胞死亡/報告系統(tǒng)多肽包含hsv-tk,其通過接頭融合至截短的變體psma多肽。

50.權(quán)利要求49的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述截短的變體psma多肽包含與seq?idno:231具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

51.權(quán)利要求47-50中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述接頭包含自體蛋白酶肽序列,所述自體蛋白酶肽序列選自p2a肽序列、t2a肽序列、e2a肽序列和f2a肽序列。

52.權(quán)利要求47-51中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述人工細(xì)胞死亡/報告系統(tǒng)多肽包含與seq?id?no:232具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

53.權(quán)利要求52的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述人工細(xì)胞死亡/報告系統(tǒng)多肽包含與選自seq?id?no:233-235的序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

54.權(quán)利要求47-53中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述人工細(xì)胞死亡/報告系統(tǒng)多肽由與選自seq?id?no:236-238的序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼。

55.權(quán)利要求1-54中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中

56.權(quán)利要求1-55中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中:

57.權(quán)利要求1-56中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中:

58.權(quán)利要求56或57的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述外源多核苷酸整合至基因座中,所述基因座獨(dú)立地選自aavs1基因座、b2m基因座、ciita基因座、ccr5基因座、cd70基因座、clybl基因座、nkg2a基因座、nkg2d基因座、cd33基因座、cd38基因座、trac基因座、trbc1基因座、rosa26基因座、htrp基因座、gapdh基因座、runx1基因座、tap1基因座、tap2基因座、tapbp基因座、nlrc5基因座、rfxank基因座、rfx5基因座、rfxap基因座、cish基因座、cblb基因座、socs2基因座、pd1基因座、ctla4基因座、lag3基因座、tim3基因座和tigit基因座。

59.權(quán)利要求58的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中:

60.權(quán)利要求1-59中任一項(xiàng)的其衍生細(xì)胞的ipsc,其中所述一種或多種外源多核苷酸還編碼一種或多種抑制性car(icar),所述抑制性car包含至少一個靶向抗原的抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域,所述抗原獨(dú)立地選自腎上腺素能受體β2(adrb2)、水通道蛋白4(aqp4)、緊密連接蛋白10(cldn10b)、橋粒芯膠蛋白(dsc)1、dsc3、橋粒芯糖蛋白(dsg)1、dsg3、含甘油磷酸二酯磷酸二酯酶結(jié)構(gòu)域2(gdpd2)、羥基羧酸受體3(hcar3)、淋巴細(xì)胞抗原6家族成員d(ly6d)以及含v組和免疫球蛋白結(jié)構(gòu)域8(vsig8)。

61.權(quán)利要求60的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar包含:

62.權(quán)利要求61的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的胞外域包含與seq?id?no:354-363中的一個或多個具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

63.權(quán)利要求61或62的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的胞外域由與seq?id?no:364-373中的一個或多個具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼。

64.權(quán)利要求61-63中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的信號肽包含cd8信號肽、gmcsfr信號肽、mars信號肽或igk信號肽,或者其變體。

65.權(quán)利要求61-63中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的信號肽包含與seqid?no:97和292之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

66.權(quán)利要求61-63中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的信號肽由與seq?idno:98、327和378之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼。

67.權(quán)利要求61-66中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的鉸鏈區(qū)選自cd28鉸鏈區(qū)、cd45鉸鏈區(qū)、g4s-cd45鉸鏈區(qū)、cd8鉸鏈區(qū)和cxc3r?gpcr鉸鏈區(qū)。

68.權(quán)利要求61-67中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的鉸鏈區(qū)包含與seqid?no:21、22、288、289、319和321之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

69.權(quán)利要求61-67中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的鉸鏈區(qū)由與seq?idno:315-318、320和322之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼。

70.權(quán)利要求61-69中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的一個或多個跨膜結(jié)構(gòu)域獨(dú)立地選自cd28跨膜結(jié)構(gòu)域、cd8跨膜結(jié)構(gòu)域、pd1跨膜結(jié)構(gòu)域、synnotch跨膜結(jié)構(gòu)域和cxc3r?gpcr。

71.權(quán)利要求61-69中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的跨膜結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:23、24、290、291、323和325之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

72.權(quán)利要求61-69中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的跨膜結(jié)構(gòu)域由與seq?id?no:324、326和374-377之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼。

73.權(quán)利要求61-72中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的胞內(nèi)信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域包含以下的一種或多種:pd1胞內(nèi)域、lirb1胞內(nèi)域、tigit胞內(nèi)域、ctla4胞內(nèi)域、csk*(yssv)胞內(nèi)域、kir2dl1胞內(nèi)域、dr1胞內(nèi)域、casp8wt胞內(nèi)域、tcasp8胞內(nèi)域、tcasp8-二聚體胞內(nèi)域、tbid15胞內(nèi)域、casp9wt胞內(nèi)域、tcasp9胞內(nèi)域、tcasp9-二聚體胞內(nèi)域、shp1胞內(nèi)域、(g4s)2-shp1胞內(nèi)域、csk胞內(nèi)域、(g4s)2-csk胞內(nèi)域、adam17切割位點(diǎn)、cd28胞內(nèi)域、cd3ζ胞內(nèi)域、g4s3接頭、adam17蛋白酶結(jié)構(gòu)域和(g4s)3-adam17蛋白酶結(jié)構(gòu)域。

74.權(quán)利要求61-72中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的胞內(nèi)信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:6、8和267-287之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

75.權(quán)利要求61-72中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的胞內(nèi)信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域由與seq?id?no:266和293-314之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼。

76.權(quán)利要求61-75中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中所述icar的共刺激結(jié)構(gòu)域選自cd28信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域、41bb信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域和dap10信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域。

77.權(quán)利要求61-76中任一項(xiàng)的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中在所述icar中:

78.權(quán)利要求77的ipsc或其衍生細(xì)胞,其中在所述icar中:

79.權(quán)利要求1-78中任一項(xiàng)的衍生細(xì)胞,其中所述衍生細(xì)胞是自然殺傷(nk)細(xì)胞或t細(xì)胞。

80.權(quán)利要求79的衍生細(xì)胞,其中所述衍生細(xì)胞為t細(xì)胞。

81.權(quán)利要求80的衍生細(xì)胞,其中所述t細(xì)胞為γδt細(xì)胞。

82.權(quán)利要求81的衍生細(xì)胞,其中所述t細(xì)胞為γδvγ9/vδ1t細(xì)胞。

83.一種組合物,其包含權(quán)利要求1-82中任一項(xiàng)的衍生細(xì)胞。

84.權(quán)利要求83的組合物,其還包含一種或多種治療劑或者與一種或多種治療劑聯(lián)合使用,所述治療劑選自肽、細(xì)胞因子、檢查點(diǎn)抑制劑、有絲分裂原、生長因子、小rna、dsrna(雙鏈rna)、sirna、寡核苷酸、單個核血細(xì)胞、包含一種或多種感興趣的多核酸的載體、抗體、化療劑或放射性部分或者免疫調(diào)節(jié)藥物(imid)。

85.一種cd34+造血祖細(xì)胞(hpc),其衍生自權(quán)利要求1-78中任一項(xiàng)的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(ipsc)。

86.權(quán)利要求85的cd34+hpc,其中:

87.權(quán)利要求85或86的cd34+hpc,其包含編碼人白細(xì)胞抗原e(hla-e)和/或人白細(xì)胞抗原g(hla-g)的外源多核苷酸。

88.權(quán)利要求85-87中任一項(xiàng)的cd34+hpc,其中所述外源多核苷酸中的一種或多種整合在細(xì)胞染色體上的一個或多個基因座上,所述基因座獨(dú)立地選自aavs1、clybl、ccr5、rosa26、膠原蛋白、htrp、hl?l、gapdh、runx1、b2m、tapi、tap2、tapasin、nlrc5、rfxank、ciita、rfx5、rfxap、tcra或b恒定區(qū)、nkg2a、nkg2d、cd33、cd38、cis、cbl-b、socs2、pd1、ctla4、lag3、tim3和tigit基因,條件是所述外源多核苷酸中的至少一種整合在選自以下基因的基因座上:b2m、tap?1、tap?2、tapasin、rfxank、ciita、rfx5和rfxap基因,從而導(dǎo)致所述基因的缺失或減少表達(dá)。

89.權(quán)利要求88的cd34+hpc,其中所述外源多核苷酸中的一種或多種整合在aavs1和b2m基因的基因座上。

90.權(quán)利要求85-89中任一項(xiàng)的cd34+hpc,其具有b2m或ciita基因中的一個或多個的缺失或減少表達(dá)。

91.權(quán)利要求85-90中任一項(xiàng)的cd34+hpc,其中所述car包含:

92.權(quán)利要求91的cd34+hpc,其中所述胞外域包含特異性結(jié)合nectin4抗原的vhh單域抗體。

93.權(quán)利要求92的cd34+hpc,其中所述胞外域包含與seq?id?no:105-130之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

94.權(quán)利要求85-93中任一項(xiàng)的cd34+hpc,其具有額外的car,所述額外的car包含:

95.權(quán)利要求94的cd34+hpc,其中所述額外的胞外域包含特異性結(jié)合選自cd70、葉酸受體α、fshr、間皮素和slitrk6的抗原的vhh。

96.權(quán)利要求85-95中任一項(xiàng)的cd34+hpc,其包含編碼cd16蛋白和nkg2d蛋白的額外的外源多核苷酸,其中所述cd16蛋白和所述nkg2d蛋白通過自體蛋白酶肽可操作地連接。

97.權(quán)利要求96的cd34+hpc,其中所述cd16蛋白為cd16變體蛋白。

98.權(quán)利要求97的cd34+hpc,其中所述cd16變體為高親和力cd16變體。

99.權(quán)利要求97或98的cd34+hpc,其中所述cd16變體為不可切割的cd16變體。

100.權(quán)利要求97-99中任一項(xiàng)的cd34+hpc,其中所述cd16變體包含一個或多個氨基酸取代,所述氨基酸取代選自f158v、f176v、s197p、d205a、s219a、t220a及其任何組合。

101.一種嵌合抗原受體(car)多肽,其包含胞外域,所述胞外域包含特異性結(jié)合至nectin4的抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域。

102.權(quán)利要求101的car,其中所述car是雙重靶向car,并且其中所述胞外域包含特異性結(jié)合至選自cd70、葉酸受體α、fshr、間皮素和slitrk6的抗原的額外的抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域。

103.權(quán)利要求101-102中任一項(xiàng)的car,其中所述car包含:

104.權(quán)利要求101-103中任一項(xiàng)的car,其中所述胞外域包含特異性結(jié)合至所述nectin4抗原的vhh單域抗體。

105.權(quán)利要求101-103中任一項(xiàng)的car,其中所述胞外域包含與seq?id?no:105-130之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

106.權(quán)利要求101-103中任一項(xiàng)的car,其中(i)所述胞外域由與seq?id?no:131-156之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼;或者(ii)所述car由與seq?id?no:171-184之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼。

107.權(quán)利要求103-106中任一項(xiàng)的car,其中所述信號肽包含gmcsfr信號肽或mars信號肽。

108.權(quán)利要求103-107中任一項(xiàng)的car,其中所述car和所述額外的car中的每一個的鉸鏈區(qū)獨(dú)立地選自cd28鉸鏈區(qū)、igg4鉸鏈區(qū)和cd8鉸鏈區(qū)。

109.權(quán)利要求103-108中任一項(xiàng)的car,其中所述car和所述額外的car中的每一個的跨膜結(jié)構(gòu)域獨(dú)立地選自cd28跨膜結(jié)構(gòu)域和cd8跨膜結(jié)構(gòu)域。

110.權(quán)利要求103-109中任一項(xiàng)的car,其中所述胞內(nèi)信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域包含cd3ζ胞內(nèi)域。

111.權(quán)利要求103-110中任一項(xiàng)的car,其中所述car和所述額外的car中的每一個的共刺激結(jié)構(gòu)域獨(dú)立地選自cd28信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域、41bb信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域和dap10信號傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)域。

112.權(quán)利要求103-111中任一項(xiàng)的car,其中在所述car中:

113.權(quán)利要求112的car,其中在所述car中:

114.一種抑制性嵌合抗原受體(icar)多肽,其包含胞外域,所述胞外域包含特異性結(jié)合至少一種選自以下的抗原的抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域:腎上腺素能受體β2(adrb2)、水通道蛋白4(aqp4)、緊密連接蛋白10(cldn10b)、橋粒芯膠蛋白(dsc)1、dsc3、橋粒芯糖蛋白(dsg)1、dsg3、含甘油磷酸二酯磷酸二酯酶結(jié)構(gòu)域2(gdpd2)、羥基羧酸受體3(hcar3)、淋巴細(xì)胞抗原6家族成員d(ly6d)、含v組和免疫球蛋白結(jié)構(gòu)域8(vsig8)。

115.權(quán)利要求114的icar,其中所述icar包含:

116.權(quán)利要求115的icar,其中所述抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域特異性結(jié)合至少一種選自dsc1、dsc3、dsg1和dsg3的抗原。

117.權(quán)利要求115的icar,其中所述抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域特異性結(jié)合至dsg1。

118.權(quán)利要求115的icar,其中所述抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域特異性結(jié)合至(i)dsg1和(ii)至少一種選自dsc1、dsc3和dsg3的抗原。

119.權(quán)利要求115-118中任一項(xiàng)的icar,其中所述icar的胞外域包含與seq?id?no:354-363中的一個或多個具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

120.權(quán)利要求115-118中任一項(xiàng)的icar,其中所述icar的胞外域由與seq?id?no:364-373中的一個或多個具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼。

121.權(quán)利要求115-120中任一項(xiàng)的icar,其中所述icar的信號肽包含cd8信號肽、gmcsfr信號肽、mars信號肽或igk信號肽,或者其變體。

122.權(quán)利要求115-120中任一項(xiàng)的icar,其中所述icar的信號肽包含與seq?id?no:97和292之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的氨基酸。

123.權(quán)利要求115-120中任一項(xiàng)的icar,其中所述icar的信號肽由與seq?id?no:98、327和378之一具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列相同性的多核苷酸編碼。

124.權(quán)利要求115-123中任一項(xiàng)的icar,其中在所述icar中:

125.權(quán)利要求124的car,其中在所述icar中:

126.權(quán)利要求1-78的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(ipsc)或其衍生細(xì)胞,其還包含權(quán)利要求114-125中任一項(xiàng)的icar。

127.一種藥物組合物,其包含權(quán)利要求126的衍生細(xì)胞。

128.一種治療有需要的受試者的癌癥的方法,其包括向有需要的受試者給藥權(quán)利要求1-82和126中任一項(xiàng)的衍生細(xì)胞或者權(quán)利要求83、84或127的組合物。

129.權(quán)利要求128的治療方法,其中所述癌癥選自白血病,如aml、cml、all和cll,淋巴瘤,如霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤和多發(fā)性骨髓瘤,以及實(shí)體癌,如肉瘤、皮膚癌、黑色素瘤、膀胱癌、腦癌、乳腺癌、子宮癌、卵巢癌、前列腺癌、肺癌、結(jié)直腸癌、宮頸癌、肝癌、頭頸癌、食管癌、胰腺癌、腎癌、腎上腺癌、胃癌、睪丸癌、膽囊和膽道癌、甲狀腺癌、胸腺癌、骨癌和大腦癌,以及原發(fā)灶不明癌(cup)。

130.權(quán)利要求127的方法,其中所述癌癥選自膀胱癌、乳腺癌、肺癌、胰腺癌、卵巢癌、頭頸癌和食管癌。

131.權(quán)利要求126-128中任一項(xiàng)的方法,其中所述受試者在初始癌癥治療后具有微小殘留病變(mrd)。

132.權(quán)利要求126-129中任一項(xiàng)的方法,其中所述受試者在一次或多次癌癥治療或者重復(fù)劑量給藥之后沒有微小殘留病變(mrd)。

133.權(quán)利要求126-130中任一項(xiàng)的方法,其還包括向所述受試者給藥治療劑,所述治療劑選自:替伊莫單抗、莫羅單抗-cd3、托西莫單抗、阿昔單抗、巴利昔單抗、維布妥昔單抗、西妥昔單抗、英夫利昔單抗、利妥昔單抗、阿侖單抗、貝伐珠單抗、賽妥珠單抗、達(dá)利珠單抗、依庫珠單抗、依法利珠單抗、吉妥珠單抗、那他珠單抗、奧馬珠單抗、帕利珠單抗、維泊妥珠單抗、雷珠單抗、托珠單抗、曲妥珠單抗、維得利珠單抗、阿達(dá)木單抗、貝利尤單抗、卡那單抗、地舒單抗、戈利木單抗、伊匹單抗、阿維魯單抗、奧法木單抗、帕尼單抗和烏司奴單抗。

134.權(quán)利要求126-130中任一項(xiàng)的方法,其還包括向所述受試者給藥治療劑,其中所述治療劑是阿維魯單抗。

135.權(quán)利要求131或132的方法,其中所述細(xì)胞和所述治療劑同時給藥。

136.權(quán)利要求131或132的方法,其中所述細(xì)胞和所述治療劑依次給藥。

137.一種制備權(quán)利要求79-82中任一項(xiàng)的衍生細(xì)胞的方法,其包括在細(xì)胞分化條件下對權(quán)利要求1-78中任一項(xiàng)的ipsc進(jìn)行分化,從而獲得所述衍生細(xì)胞。

138.權(quán)利要求135的方法,其中通過基因工程化未修飾的ipsc獲得所述ipsc,其中所述基因工程化包括ipsc基因組的靶向編輯。

139.權(quán)利要求136的方法,其中所述靶向編輯包括通過crispr、zfn、talen、歸巢核酸酶、同源重組或這些方法的任何其他功能變化進(jìn)行的缺失、插入或插入/缺失。


技術(shù)總結(jié)
本文提供了表達(dá)抗?Nectin4嵌合抗原受體(CAR)和任選存在的抑制性CAR的基因工程化誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)及其衍生細(xì)胞,以及其使用方法。本文還提供組合物、多肽、載體和制備方法。

技術(shù)研發(fā)人員:L·博爾格斯,J·M·卡頓,M·F·納索,M·沃利特,J·惠勒,M·S·霍爾
受保護(hù)的技術(shù)使用者:世紀(jì)治療股份有限公司
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2025/8/4
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